2、细胞培养法此法是检测沙眼衣原体感染最为特异的方法，此法可用作证实试验和治疗后的判愈试验。需一定的实验设备，临床没有普遍开展。

　　3、直接免疫荧光法和酶联免疫吸附试验是比较实用的检测方法。但也存在敏感性不够的缺点，可能会漏检。

　　4、快速免疫色谱试验已有商品化试剂盒用于沙眼衣原体感染的快速诊断。结果可在半小时内得到。缺点是敏感性不够。

　　5、聚合酶链反应用于诊断沙眼衣原体感染的聚合酶链反应（PCR）已有商品化试剂盒。此法对于诊断泌尿生殖道沙眼衣原体感染敏感性和特异性都非常高。核酸检测应在通过相关机构认定的实验室开展。